Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TRIM27P14373 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM27P14373 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms