Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CFTRP13569 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CFTRP13569 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CFTRP13569 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CFTRP13569 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CFTRP13569 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CFTRP13569 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CFTRP13569 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CFTRP13569 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CFTRP13569 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CFTRP13569 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CFTRP13569 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CFTRP13569 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CFTRP13569 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
CFTRP13569 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CFTRP13569 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CFTRP13569 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CFTRP13569 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CFTRP13569 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CFTRP13569 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CFTRP13569 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CFTRP13569 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CFTRP13569 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CFTRP13569 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
CFTRP13569 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CFTRP13569 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
CFTRP13569 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CFTRP13569 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CFTRP13569 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CFTRP13569 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CFTRP13569 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CFTRP13569 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CFTRP13569 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
CFTRP13569 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CFTRP13569 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CFTRP13569 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CFTRP13569 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CFTRP13569 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CFTRP13569 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CFTRP13569 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CFTRP13569 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
CFTRP13569 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CFTRP13569 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
CFTRP13569 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CFTRP13569 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CFTRP13569 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CFTRP13569 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
CFTRP13569 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CFTRP13569 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CFTRP13569 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CFTRP13569 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CFTRP13569 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CFTRP13569 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CFTRP13569 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CFTRP13569 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
CFTRP13569 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CFTRP13569 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CFTRP13569 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFTRP13569 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFTRP13569 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFTRP13569 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
CFTRP13569 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFTRP13569 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
CFTRP13569 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFTRP13569 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFTRP13569 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFTRP13569 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFTRP13569 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CFTRP13569 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CFTRP13569 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CFTRP13569 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CFTRP13569 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CFTRP13569 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CFTRP13569 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CFTRP13569 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CFTRP13569 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CFTRP13569 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CFTRP13569 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CFTRP13569 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CFTRP13569 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CFTRP13569 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CFTRP13569 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CFTRP13569 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CFTRP13569 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CFTRP13569 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CFTRP13569 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CFTRP13569 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CFTRP13569 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CFTRP13569 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CFTRP13569 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CFTRP13569 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CFTRP13569 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CFTRP13569 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CFTRP13569 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CFTRP13569 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CFTRP13569 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
CFTRP13569 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CFTRP13569 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CFTRP13569 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CFTRP13569 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms