Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MCF2P10911 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MCF2P10911 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCF2P10911 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCF2P10911 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCF2P10911 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCF2P10911 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCF2P10911 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCF2P10911 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCF2P10911 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCF2P10911 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCF2P10911 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCF2P10911 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCF2P10911 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCF2P10911 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCF2P10911 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCF2P10911 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCF2P10911 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCF2P10911 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCF2P10911 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCF2P10911 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCF2P10911 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCF2P10911 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCF2P10911 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCF2P10911 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCF2P10911 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCF2P10911 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCF2P10911 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCF2P10911 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCF2P10911 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCF2P10911 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCF2P10911 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCF2P10911 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCF2P10911 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCF2P10911 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCF2P10911 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCF2P10911 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCF2P10911 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCF2P10911 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCF2P10911 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCF2P10911 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCF2P10911 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCF2P10911 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCF2P10911 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MCF2P10911 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCF2P10911 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCF2P10911 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCF2P10911 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCF2P10911 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MCF2P10911 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCF2P10911 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCF2P10911 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MCF2P10911 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCF2P10911 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCF2P10911 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MCF2P10911 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCF2P10911 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCF2P10911 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCF2P10911 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCF2P10911 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCF2P10911 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCF2P10911 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCF2P10911 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCF2P10911 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCF2P10911 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCF2P10911 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCF2P10911 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCF2P10911 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCF2P10911 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCF2P10911 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCF2P10911 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCF2P10911 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCF2P10911 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCF2P10911 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCF2P10911 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCF2P10911 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCF2P10911 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCF2P10911 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCF2P10911 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCF2P10911 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCF2P10911 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCF2P10911 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCF2P10911 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCF2P10911 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCF2P10911 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCF2P10911 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MCF2P10911 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCF2P10911 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCF2P10911 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCF2P10911 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCF2P10911 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCF2P10911 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCF2P10911 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCF2P10911 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCF2P10911 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCF2P10911 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCF2P10911 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCF2P10911 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCF2P10911 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCF2P10911 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms