Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CHGAP10645 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CHGAP10645 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CHGAP10645 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CHGAP10645 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHGAP10645 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CHGAP10645 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHGAP10645 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHGAP10645 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHGAP10645 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHGAP10645 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CHGAP10645 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHGAP10645 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHGAP10645 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHGAP10645 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHGAP10645 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHGAP10645 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHGAP10645 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CHGAP10645 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHGAP10645 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHGAP10645 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHGAP10645 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHGAP10645 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHGAP10645 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CHGAP10645 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHGAP10645 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHGAP10645 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHGAP10645 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHGAP10645 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHGAP10645 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHGAP10645 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHGAP10645 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHGAP10645 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHGAP10645 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHGAP10645 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CHGAP10645 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHGAP10645 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHGAP10645 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHGAP10645 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHGAP10645 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHGAP10645 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHGAP10645 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHGAP10645 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHGAP10645 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHGAP10645 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHGAP10645 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHGAP10645 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHGAP10645 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHGAP10645 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHGAP10645 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHGAP10645 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHGAP10645 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHGAP10645 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CHGAP10645 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHGAP10645 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHGAP10645 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHGAP10645 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHGAP10645 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHGAP10645 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHGAP10645 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHGAP10645 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHGAP10645 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHGAP10645 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHGAP10645 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHGAP10645 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHGAP10645 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CHGAP10645 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CHGAP10645 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHGAP10645 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHGAP10645 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHGAP10645 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHGAP10645 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CHGAP10645 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHGAP10645 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHGAP10645 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHGAP10645 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHGAP10645 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHGAP10645 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHGAP10645 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHGAP10645 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHGAP10645 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CHGAP10645 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHGAP10645 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHGAP10645 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHGAP10645 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHGAP10645 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHGAP10645 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHGAP10645 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHGAP10645 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHGAP10645 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHGAP10645 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHGAP10645 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHGAP10645 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHGAP10645 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHGAP10645 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHGAP10645 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHGAP10645 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHGAP10645 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHGAP10645 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHGAP10645 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms