Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms