Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYCNP04198 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MYCNP04198 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYCNP04198 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYCNP04198 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYCNP04198 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCNP04198 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCNP04198 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCNP04198 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCNP04198 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCNP04198 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCNP04198 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCNP04198 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCNP04198 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCNP04198 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCNP04198 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCNP04198 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCNP04198 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCNP04198 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCNP04198 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCNP04198 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCNP04198 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCNP04198 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCNP04198 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCNP04198 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCNP04198 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCNP04198 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCNP04198 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCNP04198 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCNP04198 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCNP04198 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYCNP04198 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCNP04198 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCNP04198 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCNP04198 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCNP04198 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCNP04198 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCNP04198 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCNP04198 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCNP04198 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCNP04198 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCNP04198 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCNP04198 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCNP04198 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCNP04198 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCNP04198 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCNP04198 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCNP04198 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCNP04198 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCNP04198 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYCNP04198 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYCNP04198 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYCNP04198 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYCNP04198 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYCNP04198 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYCNP04198 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYCNP04198 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYCNP04198 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYCNP04198 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MYCNP04198 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MYCNP04198 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYCNP04198 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYCNP04198 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MYCNP04198 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MYCNP04198 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYCNP04198 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYCNP04198 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYCNP04198 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYCNP04198 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCNP04198 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCNP04198 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCNP04198 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCNP04198 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCNP04198 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCNP04198 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCNP04198 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCNP04198 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCNP04198 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCNP04198 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCNP04198 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCNP04198 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCNP04198 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCNP04198 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCNP04198 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCNP04198 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCNP04198 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCNP04198 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCNP04198 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCNP04198 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCNP04198 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCNP04198 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYCNP04198 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYCNP04198 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYCNP04198 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYCNP04198 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYCNP04198 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYCNP04198 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYCNP04198 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYCNP04198 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYCNP04198 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms