Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOA1P02647 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA1P02647 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA1P02647 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA1P02647 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA1P02647 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA1P02647 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA1P02647 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA1P02647 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA1P02647 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA1P02647 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA1P02647 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA1P02647 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA1P02647 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA1P02647 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA1P02647 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA1P02647 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA1P02647 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA1P02647 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA1P02647 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA1P02647 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA1P02647 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA1P02647 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA1P02647 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA1P02647 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA1P02647 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA1P02647 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA1P02647 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOA1P02647 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA1P02647 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA1P02647 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA1P02647 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA1P02647 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA1P02647 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA1P02647 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA1P02647 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA1P02647 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA1P02647 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA1P02647 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA1P02647 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA1P02647 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA1P02647 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA1P02647 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA1P02647 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA1P02647 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA1P02647 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA1P02647 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA1P02647 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA1P02647 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA1P02647 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA1P02647 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA1P02647 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA1P02647 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA1P02647 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOA1P02647 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA1P02647 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA1P02647 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA1P02647 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA1P02647 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA1P02647 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA1P02647 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA1P02647 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA1P02647 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA1P02647 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA1P02647 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA1P02647 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA1P02647 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA1P02647 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA1P02647 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA1P02647 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA1P02647 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA1P02647 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA1P02647 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA1P02647 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA1P02647 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA1P02647 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA1P02647 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA1P02647 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA1P02647 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA1P02647 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOA1P02647 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA1P02647 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA1P02647 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA1P02647 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA1P02647 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA1P02647 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA1P02647 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA1P02647 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms