Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX58O95786 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX58O95786 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX58O95786 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX58O95786 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX58O95786 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX58O95786 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX58O95786 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX58O95786 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX58O95786 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX58O95786 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX58O95786 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX58O95786 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX58O95786 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX58O95786 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX58O95786 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX58O95786 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX58O95786 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX58O95786 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX58O95786 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX58O95786 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX58O95786 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX58O95786 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX58O95786 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX58O95786 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX58O95786 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX58O95786 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX58O95786 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX58O95786 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX58O95786 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX58O95786 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX58O95786 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX58O95786 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX58O95786 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX58O95786 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX58O95786 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX58O95786 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX58O95786 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX58O95786 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX58O95786 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX58O95786 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX58O95786 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX58O95786 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX58O95786 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX58O95786 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX58O95786 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX58O95786 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX58O95786 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX58O95786 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX58O95786 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX58O95786 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX58O95786 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX58O95786 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX58O95786 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX58O95786 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX58O95786 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX58O95786 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX58O95786 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX58O95786 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX58O95786 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX58O95786 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX58O95786 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX58O95786 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX58O95786 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX58O95786 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX58O95786 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX58O95786 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX58O95786 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX58O95786 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX58O95786 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX58O95786 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX58O95786 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX58O95786 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX58O95786 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX58O95786 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX58O95786 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX58O95786 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX58O95786 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX58O95786 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX58O95786 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX58O95786 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX58O95786 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX58O95786 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX58O95786 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX58O95786 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX58O95786 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX58O95786 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX58O95786 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX58O95786 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX58O95786 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX58O95786 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX58O95786 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX58O95786 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX58O95786 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX58O95786 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX58O95786 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX58O95786 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX58O95786 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX58O95786 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX58O95786 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms