Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC40.33■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC40.32■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC40.32■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC40.26■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
ABCC9O60706 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.25■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
ABCC9O60706 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms