Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms