Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms