Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms