Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2AO43633 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2AO43633 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms