Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPRY3O43610 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms