Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPAA1O43292 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms