Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DFFAO00273 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DFFAO00273 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DFFAO00273 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DFFAO00273 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DFFAO00273 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DFFAO00273 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DFFAO00273 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DFFAO00273 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DFFAO00273 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DFFAO00273 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DFFAO00273 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DFFAO00273 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DFFAO00273 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DFFAO00273 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DFFAO00273 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DFFAO00273 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DFFAO00273 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DFFAO00273 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DFFAO00273 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DFFAO00273 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DFFAO00273 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DFFAO00273 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DFFAO00273 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DFFAO00273 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
DFFAO00273 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DFFAO00273 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DFFAO00273 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DFFAO00273 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DFFAO00273 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DFFAO00273 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DFFAO00273 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DFFAO00273 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DFFAO00273 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DFFAO00273 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DFFAO00273 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DFFAO00273 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DFFAO00273 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DFFAO00273 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DFFAO00273 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DFFAO00273 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DFFAO00273 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DFFAO00273 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DFFAO00273 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DFFAO00273 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DFFAO00273 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DFFAO00273 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DFFAO00273 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DFFAO00273 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DFFAO00273 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DFFAO00273 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DFFAO00273 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DFFAO00273 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DFFAO00273 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DFFAO00273 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DFFAO00273 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DFFAO00273 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DFFAO00273 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DFFAO00273 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DFFAO00273 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DFFAO00273 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DFFAO00273 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DFFAO00273 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DFFAO00273 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DFFAO00273 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DFFAO00273 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DFFAO00273 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DFFAO00273 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DFFAO00273 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DFFAO00273 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DFFAO00273 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DFFAO00273 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DFFAO00273 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DFFAO00273 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DFFAO00273 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DFFAO00273 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DFFAO00273 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DFFAO00273 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DFFAO00273 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DFFAO00273 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DFFAO00273 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DFFAO00273 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DFFAO00273 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DFFAO00273 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DFFAO00273 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DFFAO00273 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DFFAO00273 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DFFAO00273 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DFFAO00273 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DFFAO00273 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DFFAO00273 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DFFAO00273 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DFFAO00273 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DFFAO00273 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DFFAO00273 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DFFAO00273 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DFFAO00273 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DFFAO00273 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DFFAO00273 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DFFAO00273 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms