Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN34H7C241 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms