Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BL2E5RIL1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
UPK3BL2E5RIL1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPK3BL2E5RIL1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPK3BL2E5RIL1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPK3BL2E5RIL1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPK3BL2E5RIL1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPK3BL2E5RIL1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPK3BL2E5RIL1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPK3BL2E5RIL1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPK3BL2E5RIL1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPK3BL2E5RIL1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPK3BL2E5RIL1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPK3BL2E5RIL1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPK3BL2E5RIL1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPK3BL2E5RIL1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPK3BL2E5RIL1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPK3BL2E5RIL1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPK3BL2E5RIL1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPK3BL2E5RIL1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPK3BL2E5RIL1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPK3BL2E5RIL1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPK3BL2E5RIL1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPK3BL2E5RIL1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPK3BL2E5RIL1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms