Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPBD1B2RD01 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms