Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPDC1A2A3K4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms