Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
E2F8A0AVK6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms