Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC104938.1-203ENST00000561834 546 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC008736.1-201ENST00000592431 568 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AL356052.1-201ENST00000605764 376 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AL096855.2-201ENST00000605785 369 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 SMIM11B-201ENST00000612624 1021 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 Metazoa_SRP.39-201ENST00000614194 271 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC090373.1-201ENST00000623955 603 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 SATB1-AS1-242ENST00000627496 807 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC068205.4-201ENST00000637880 804 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC087885.1-201ENST00000641910 848 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 OR4F15-201ENST00000332238 2119 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 ARPP21-221ENST00000444190 3182 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 EEF1A1P2-201ENST00000553854 1447 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 TDRD12-201ENST00000421545 1317 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 TRIM64EP-201ENST00000531233 1307 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 OSBPL6-202ENST00000315022 2999 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 UPP2-201ENST00000005756 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 IL12B-201ENST00000231228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 CDC42-201ENST00000315554 1452 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 CDYLP1-201ENST00000419017 1458 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 ZG16-201ENST00000400752 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 C14orf177-201ENST00000325812 1284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 DEFB105B-201ENST00000335510 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 PSMD10-203ENST00000340200 713 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 CSN2-201ENST00000353151 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 BEND6-201ENST00000370745 579 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 SEC61G-202ENST00000395535 459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 SNRK-AS1-201ENST00000422681 750 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AL162724.2-201ENST00000426157 308 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC245047.1-201ENST00000433276 873 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AL031736.1-201ENST00000449688 618 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AL356311.1-201ENST00000451697 258 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 VN1R6P-201ENST00000458417 907 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 LINC00499-203ENST00000510736 587 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 LAMTOR5-AS1-205ENST00000587691 441 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC093063.1-201ENST00000599317 363 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AL731533.2-201ENST00000607898 578 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC103974.2-201ENST00000611319 778 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 MIR6872-201ENST00000612981 62 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 BX255923.1-201ENST00000613309 681 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 PTP4A1-206ENST00000627002 447 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AL390036.1-203ENST00000635340 894 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 RUNDC3A-AS1-202ENST00000588097 5203 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 CASP12-201ENST00000375726 1306 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 NUCB2-201ENST00000323688 1905 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 UBE2U-206ENST00000611228 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AL354719.2-201ENST00000429530 1454 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 KIAA1257-205ENST00000515659 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 MIR555-201ENST00000384987 96 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 MIR575-201ENST00000385013 94 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 PHBP1-201ENST00000392260 808 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 RN7SKP168-201ENST00000410910 300 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AL358942.1-201ENST00000418595 1178 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms