Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AC020549.1-201ENST00000536916 1440 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AC096745.2-201ENST00000627783 1914 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 OR8H1-203ENST00000641600 2927 ntAPPRIS P2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 NEDD4L-207ENST00000435432 3417 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 OR10W1-201ENST00000395079 1469 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 DUBR-202ENST00000466734 2737 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AC130464.1-201ENST00000416201 1500 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 SNORA71D-201ENST00000363484 134 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 MGST3-202ENST00000367884 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 LINC00222-203ENST00000416890 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 RBM22P7-201ENST00000421321 280 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AP001342.1-201ENST00000423389 525 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 IYD-207ENST00000425615 684 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AC007879.1-201ENST00000435643 554 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AC140479.1-201ENST00000440423 337 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AC016683.1-201ENST00000446590 559 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 GAPDHP28-201ENST00000455134 1003 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 RN7SL740P-201ENST00000467060 344 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 ZBTB20-AS4-201ENST00000472323 675 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 PRICKLE2-AS2-201ENST00000484703 496 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AC116353.1-201ENST00000489727 316 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 SUMO2P17-201ENST00000504438 285 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 CARD8-214ENST00000520007 614 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 LINC02365-203ENST00000522554 802 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 TSPAN8-203ENST00000546561 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AC078955.1-201ENST00000547123 882 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AC233290.1-201ENST00000553021 1186 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AL160314.2-202ENST00000553792 534 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 DNM1P33-201ENST00000565222 270 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 TTC39A-AS1-202ENST00000568425 554 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 RN7SL473P-201ENST00000580341 299 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 MIR4437-201ENST00000581331 60 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AC137735.1-201ENST00000581911 419 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 MIR4664-201ENST00000583819 71 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AC068631.1-229ENST00000599314 739 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 SLC6A21P-201ENST00000599458 369 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 UBE2V2-207ENST00000523111 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 FHL1-204ENST00000370683 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 PAX8-AS1-213ENST00000609210 1328 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 IL18RAP-202ENST00000409369 1890 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 ZSCAN9-207ENST00000531979 1601 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 GLRX-202ENST00000379979 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AC107058.1-201ENST00000513297 1384 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 SLC13A3-202ENST00000290317 3994 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AC022784.6-204ENST00000520390 3442 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 LGI1-211ENST00000630047 1751 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 TMEM267-202ENST00000500337 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AC135178.2-201ENST00000582471 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 TRAF6P1-201ENST00000429404 1558 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 RGS7-202ENST00000366563 2206 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 C15orf41-202ENST00000437989 2240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 ORM1-201ENST00000259396 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 PSG9-203ENST00000291752 1055 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 GAGE2A-201ENST00000362097 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 SNORA10B-201ENST00000384458 133 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 RNA5SP23-201ENST00000391006 105 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 VDAC1P8-201ENST00000406025 853 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TMEM225BP0DP42 AL358779.1-201ENST00000415465 400 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms