Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CREM-216ENST00000429130 1476 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTTY11-201ENST00000253470 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP204-201ENST00000365481 310 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353662.2-201ENST00000372214 645 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA70I-201ENST00000384544 135 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01644-201ENST00000405369 984 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136968.2-201ENST00000407959 354 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00111-201ENST00000413718 575 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC019181.1-201ENST00000417151 310 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC003986.3-201ENST00000417460 692 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001630.1-201ENST00000428410 437 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z83313.1-201ENST00000433780 718 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPSAP17-201ENST00000437336 883 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011193.1-202ENST00000441287 323 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM22P5-201ENST00000449536 1277 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUCKS1P1-201ENST00000452067 703 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM10L2B-AS1-201ENST00000453528 1027 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445673.1-201ENST00000455124 416 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL156P-201ENST00000480334 304 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008481.2-201ENST00000483614 531 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC024022.1-201ENST00000503321 598 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMT112P1-201ENST00000505515 351 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC109927.1-203ENST00000507038 421 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023644.1-201ENST00000523380 859 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNC-215ENST00000523799 1035 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010931.1-201ENST00000565063 386 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC135048.2-201ENST00000572471 561 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099684.3-201ENST00000574483 560 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093826.2-201ENST00000579042 108 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00969-229ENST00000596584 863 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005197.1-201ENST00000597769 683 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020909.3-201ENST00000598194 375 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC063950.1-202ENST00000600133 568 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC140658.6-201ENST00000603958 201 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL096855.2-201ENST00000605785 369 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL726P-201ENST00000605957 299 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNG2-216ENST00000615906 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CU639417.5-201ENST00000623983 476 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HRG-201ENST00000232003 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF728-201ENST00000594710 2015 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKZF3-209ENST00000377952 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC061975.5-201ENST00000584928 1441 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCR3-208ENST00000545097 1786 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CORIN-207ENST00000505909 3018 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079316.2-201ENST00000623545 1375 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSL3-203ENST00000361672 2256 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYDC2-207ENST00000616870 1723 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL22-206ENST00000522038 3162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAS2R5-201ENST00000247883 1151 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNASE3-201ENST00000304639 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRLR-202ENST00000310101 1297 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR56B3P-201ENST00000316517 947 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP145-201ENST00000363124 125 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIART-202ENST00000369094 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC121338.1-201ENST00000380601 1287 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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