Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 FAR2-202ENST00000536681 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 ARPP21-221ENST00000444190 3182 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 ASIC5-201ENST00000537611 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 SLC2A3-201ENST00000075120 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 LINC01359-204ENST00000447748 2804 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 OR4D9-201ENST00000329328 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RNA5SP263-201ENST00000363376 128 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RPL5P5-201ENST00000392009 893 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 TERF1P4-201ENST00000399580 1115 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 PKMP3-201ENST00000405497 715 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 GRIK1-AS1-202ENST00000412579 818 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 LINC01353-201ENST00000412772 775 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RPL34P19-201ENST00000415903 342 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RBMY2FP-202ENST00000420346 1263 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 OR10J1-201ENST00000423932 1090 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AL356309.1-201ENST00000425153 339 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RPL5P34-201ENST00000426545 891 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 MTRF1-204ENST00000430347 557 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AL137220.1-201ENST00000431369 661 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 GAPDHP32-201ENST00000433816 998 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RPL5P9-201ENST00000448118 886 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AL583856.1-201ENST00000454078 1101 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC011005.4-201ENST00000466717 535 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RN7SL36P-201ENST00000469345 276 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 LINC02024-203ENST00000496994 489 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AF279873.3-204ENST00000523336 784 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AP004833.3-201ENST00000531893 322 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 NOVA1-209ENST00000547619 947 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC073611.1-201ENST00000550263 647 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC078905.1-201ENST00000560803 509 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 GOSR1-212ENST00000581721 756 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC015911.3-201ENST00000592908 849 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 CD86-209ENST00000493101 1572 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 KIFAP3-203ENST00000367767 2718 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC090132.1-201ENST00000524071 1480 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC004672.1-201ENST00000513082 2088 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 FOLH1-213ENST00000533034 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 IL31RA-207ENST00000490985 2414 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 OR4F15-201ENST00000332238 2119 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 FAM122C-201ENST00000370784 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 MBL2-201ENST00000373968 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 HABP2-203ENST00000542051 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 TIAL1-205ENST00000436547 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 TCAM1P-205ENST00000478379 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 PRLR-202ENST00000310101 1297 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 OR13H1-201ENST00000338616 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 UBE2D3-205ENST00000350435 711 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 DYNLRB1-202ENST00000357156 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RNA5SP71-201ENST00000362967 126 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 CBWD5-205ENST00000377395 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 GAS8-AS1-201ENST00000408886 435 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 CDH13-203ENST00000431540 831 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 EIF3IP1-201ENST00000433048 967 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 LINC01865-202ENST00000436808 853 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AL590682.1-201ENST00000437248 344 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 TULP3P1-201ENST00000442322 816 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC239860.1-201ENST00000444680 1270 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC239798.1-201ENST00000449024 1176 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC092570.2-201ENST00000452117 1143 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AL590326.1-201ENST00000460857 334 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RPL12P40-201ENST00000467028 488 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 BX890604.1-206ENST00000471090 922 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 SERPINB5-205ENST00000489441 1268 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 LINC00499-203ENST00000510736 587 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC017007.5-201ENST00000511590 874 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC113352.1-201ENST00000513196 666 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 DKK2-204ENST00000513208 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 LINC01944-201ENST00000517916 416 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 OSTCP1-202ENST00000522287 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC092818.1-201ENST00000523411 639 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 FXYD2-206ENST00000532119 562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 TMEM132D-AS1-204ENST00000537367 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 GNPTAB-203ENST00000549165 373 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC026111.1-201ENST00000551090 1195 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 PSMA3-AS1-210ENST00000556002 1039 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 GNG2-215ENST00000557376 573 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 CDH13-207ENST00000565636 810 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RBM4-213ENST00000578778 582 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC011840.3-201ENST00000579378 280 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC009716.1-201ENST00000583287 398 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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