Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
HIGD1AQ9Y241 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD1AQ9Y241 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms