Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AGAP1Q9UPQ3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AGAP1Q9UPQ3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms