Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN2Q9UNF0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN2Q9UNF0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN2Q9UNF0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN2Q9UNF0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN2Q9UNF0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN2Q9UNF0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN2Q9UNF0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN2Q9UNF0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN2Q9UNF0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN2Q9UNF0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN2Q9UNF0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN2Q9UNF0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN2Q9UNF0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN2Q9UNF0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN2Q9UNF0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN2Q9UNF0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PACSIN2Q9UNF0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PACSIN2Q9UNF0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PACSIN2Q9UNF0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PACSIN2Q9UNF0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PACSIN2Q9UNF0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PACSIN2Q9UNF0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PACSIN2Q9UNF0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PACSIN2Q9UNF0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PACSIN2Q9UNF0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PACSIN2Q9UNF0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PACSIN2Q9UNF0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms