Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COPG2Q9UBF2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPG2Q9UBF2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPG2Q9UBF2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPG2Q9UBF2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPG2Q9UBF2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPG2Q9UBF2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPG2Q9UBF2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPG2Q9UBF2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPG2Q9UBF2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPG2Q9UBF2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPG2Q9UBF2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
COPG2Q9UBF2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPG2Q9UBF2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPG2Q9UBF2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPG2Q9UBF2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COPG2Q9UBF2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms