Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ORC3Q9UBD5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ORC3Q9UBD5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms