Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TVP23BQ9NYZ1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TVP23BQ9NYZ1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms