Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT1Q9NXH9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms