Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOMER3Q9NSC5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOMER3Q9NSC5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms