Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL1Q9NSC2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms