Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CYLDQ9NQC7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYLDQ9NQC7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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