Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKRIP1Q9H875 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKRIP1Q9H875 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms