Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNCQ9H7C4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms