Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SENP3Q9H4L4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 AL121694.1-201ENST00000554253 671 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 LINC02349-201ENST00000561386 963 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 AC097487.1-201ENST00000514134 934 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 PPP1R26-AS1-201ENST00000455039 643 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 LINC02407-202ENST00000553247 1083 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 AC018362.1-201ENST00000564805 846 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SENP3Q9H4L4 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms