Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
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