Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4AQ9BY43 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP4AQ9BY43 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms