Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms