Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms