Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms