Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3CQ9BUI4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms