Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms