Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms