Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NSMCE2Q96MF7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NSMCE2Q96MF7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms