Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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C9orf85Q96MD7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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C9orf85Q96MD7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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C9orf85Q96MD7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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C9orf85Q96MD7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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C9orf85Q96MD7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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C9orf85Q96MD7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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C9orf85Q96MD7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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C9orf85Q96MD7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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C9orf85Q96MD7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf85Q96MD7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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