Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPNS2Q96L46 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms