Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
VCPIP1Q96JH7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VCPIP1Q96JH7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms